非小細胞肺癌(NSCLC)の5つの遺伝子表現型と臨床的アウトカム

腫瘍の病期分類、予後の推定に分子生物学的方法を用いる、とっかかりの仕事になるだろうと評されている論文。


A Five-Gene Signature and Clinical Outcome in Non–Small-Cell Lung Cancer
NEJM Volume 356:11-20 January 4, 2007 Number 1
185の凍結標本を microarray analysis、 real-time reverse-transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) analysis、その両者行ったもの
NSCLC手術をうけた125名のランダム選択した患者の肺癌組織凍結標本の遺伝子発現研究
リスクスコアやdecision-tree analysisをNSCLC治療のアウトカム予測の遺伝子発現モデル構築のため用いたもの。60の対照

【結果】NSCLCと関連した16の遺伝子をmicroarray data解析にて検討したものとリスクスコアの相関。
RT-PCRの5つの遺伝子 (DUSP6, MMD, STAT1, ERBB3, and LCK)とdecision-tree analysisを選択
この5つの遺伝子は独立した、relapse-freeおよびoverall survivalの予後因子であった。

別の60名のコホートデータで評価したものを発表



肺癌を含めたガン全般に、microarrayと reverse-transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR)を用いた遺伝子発現プロファイリング(Gene-expression profiling:glossary参考)
が腫瘍の分類や予後分類に役立つようになってきている。
しかし、現実には、臨床の場ではまだ、microarrayの利用は限られており、profillingに多くの数の遺伝子が必要であること、再現性、独立性の証明がないことがその原因と考えられる。

プロファイリング施行する上で、5つの遺伝子に絞ることは、その臨床的応用の普及に役立つこととなるだろう。



本論文付記のGlossary

Decision tree: A statistical tool for predicting which patient belongs to which specific class (e.g., good or poor clinical outcome) on the basis of feature information (gene-expression levels), with the use of a recursive-partitioning process and tree-based classification rules.

Gene-expression profiling: Determination of the level of expression of thousands of genes simultaneously by DNAmicroarray or real-time RT-PCR.

High-risk gene signature: Aberrant expression of a panel of genes in tissue that signifies a high risk of an adverse outcome (relapse or death in patients with cancer).

Independent cohort: An independent group of patients having clinical characteristics similar to those of an original group of patients in a study. The independent cohort is used to confirm the findings of the original study.

Risk gene: A gene for which altered expression in the tissue of interest is associated with an increased risk of an adverse clinical outcome (relapse or death in patients with cancer).

Risk score: A score that predicts the likelihood of an individual patient's survival on the basis of statistical analysisof risk factors (the expression levels of risk genes) associated with survival.




念頭の雑談だが・・・
金がかかる診断方法が増えそうだが、経団連主導阿部内閣では、こういった技術の発展によるコストアップは無視して、医療費を削減するそうだ。経団連幹部に某製薬会社が名を連ねているのだが、こういったことを知っているはずなのに、無視なのだろうか?
無視し続ければ、現場の医者の怒りは・・・

by internalmedicine | 2007-01-04 09:14 | 呼吸器系  

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