9p2１と心疾患の関係

9p21と特定疾患の関係は後述と”2型糖尿病における血糖コントロールと9p21　 2008-11-26”などで言及。以前はメラノーマ関係が取りざたされていたと思うのだが・・・


9p21　genomic markerと心疾患の関連

Association Between 9p21 Genomic Markers and Heart Disease: A Meta-analysis
Glenn E. Palomaki; Stephanie Melillo; Linda A. Bradley
JAMA. 2010;303(7):648-656

２２文献からの５７のデータセットで、症例３５８７２例と対照９５８３７例

リスクalleleの　２　ｖｓ　１　心疾患要約ORは、低から中等度heterogeneityをの 1.25(95%　信頼区間[CI], 1.21-1.29）

疾患診断年齢は有意に共役的で、５５歳以下で、ORs 1.35 (95% CI, 1.30-1.40)、７５歳以下で　1.21 (95% CI, 1.16-1.25)

６５歳以下で、１０年心疾患リスクは、リスクalleles ２　ｖｓ　１で、13.2% vs 11%　
４０歳女性では、１０年心疾患リスクは、リスクalleles 2 vs 1で、2.4% vs 2.0%

リスクalleles 1 vs 0比較では、同定できるが逆の結果が見られた。

net reclassification indexは -0.1%-4.8%の範囲

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9p21物語は、２００７年６月からで、USなどからのコホートで、この部分のSNPが、冠動脈疾患・心筋梗塞と高度関連があるということから始まった。

A Common Allele on Chromosome 9 Associated with Coronary Heart Disease Science p. 1488-1491.
A Common Variant on Chromosome 9p21 Affects the Risk of Myocardial Infarction Science p. 1491-1493.


9p21で関連する遺伝子は単一ではない。

CDKN2Bが腫瘍抑制として知られ、細胞サイクル造成、老化、加齢と関連し、心臓発作とは関連を示さなかった。
さらに２００８年Nature Geneticsに、DeCODEグループが、9p21の２つのSNPｓは別別のものであり、糖尿病関連SNPは血管phenotypeと関連なく、糖尿病と関連したSNPが確認された。
一方、腹部大動脈瘤と頭蓋内動脈瘤が大きく関連するSNPが見いだされた。triple A、頭蓋内動脈瘤、心筋梗塞／冠動脈疾患に関するオッズ比１．３というSNPであった。

Helgadottir A, Thorleifsson G, Magnusson KP, et al. The same sequence variant on 9p21 associates with myocardial infarction, abdominal aortic aneurysm and intracranial aneurysm. Nat Genet. 2008 Jan 6;